一、项目编号:
SZUCG20220049FW
二、项目名称:
小鼠脊柱发育的单细胞转录组与空间转录组分析
三、投标供应商名称及报价(适用于公开招标):
序号
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投标人名称
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投标报价(人民币/元)
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投标文件解密状态
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1
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新格元(南京)生物科技有限公司
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378,200.00
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正常解密
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2
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深圳市百诺星?科技有限公司
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379,200.00
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正常解密
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3
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荔园基因科技(深圳)有限公司
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378,700.00
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正常解密
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四、候选中标供应商名单(适用于公开招标):
深圳市百诺星?科技有限公司,荔园基因科技(深圳)有限公司
五、中标(成交)信息
供应商名称:新格元(南京)生物科技有限公司
供应商地址:南京市江北新区药谷大道11号加速器二期6栋5楼 211500
中标(成交)金额: 378,200.00元
六、主要标的信息
(服务类)
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名称
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服务范围
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服务内容
完成9例样本的单细胞转录组测序及其个性化分析;每个样本交付数据量不低于90G,且目标捕获细胞数≥6000个。同时进行5例样本的空间转录组建库测序,交付数据量250M reads/样本;并完成空间转录组标准分析、单细胞转录组和空间转录组的联合分析。
1. 合同签订后1天内,可提供保存效果长达72h的组织保存液;
2. 样本接收后1天内,可完成单细胞悬液制备,活性要求≥85%,浓度≥1*105 cells/ml;
3. 合同签订后14天内,完成所有样本的文库构建工作并提供文库质检报告。
4. 合同签订后1个月内完成所有样本的测序工作,测序质量及深度符合采购方要求,并提供标准化分析结果。
5. 合同生效后2个月内完成采购方要求的所有样本测序结果个性化分析。
6. 可提供生信分析服务到采购方学术成果正式发表为止。
7. 服务范围:组织取材、包埋、检测、实验经过汇报、项目结题报告。
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服务要求
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服务要求
1、样本处理要求:(1)单细胞转录组提供组织样本的保存试剂,保证样本离体72h后的稳定性,并能够用于后续单细胞悬液的制备。具备单细胞解离试剂,可对样本进行单细胞悬液的制备,单细胞解离试剂适用性广,可应用于多种样本类型的处理,解离过程不超过90分钟,解离活性要求≥85%,浓度≥1*105 cells/ml。(2)空间转录组样本包埋组织提取RNA,进行检测,RIN值大于7。
2、平台要求:利用荧光计数法和台盼蓝染色法两种方式同时进行细胞计数,随后对悬液进行单细胞捕获并构建测序文库;
3、建库和测序需求:(1)具备单细胞建库试剂盒,可用单细胞悬液构建带标签的转录组测序文库,可以满足不同样本的建库需求。采用安捷伦核酸片段分析仪对构建好的文库进行文库质量检测,对符合标准的文库进行后续的上机测序。
4、数据质控要求:(1)单细胞转录组对符合合格标准(活性≥85%,细胞总数≥1*105)的样本,目标捕获细胞数不低于6000个细胞/样本,测序数据量90G/样本。测序质量要求:Q20>85%,Q30>80%,碱基类型分布均匀;采用严格的数据指控标准,保证数据质量。(2)空间转录组数据量250M reads/样本。
5、数据验收标准
交付所有测序原始数据以及clean data记录报告及分析结果。
标准分析内容:QC分析、细胞分群、细胞分型展示、差异基因分析、monocle轨迹分析、marker基因展示、富集分析、蛋白互作网络、转录因子注释等。
个性化分析内容:细胞注释、批次效应去除、异质性分析、组间比对、轨迹分析(拟时序,RNA velocity)、通路分析、细胞通讯(细胞互作分析,转录因子调控网络分析)、细胞周期分析、细胞基因集合AUC分析、cNMF基因集合分析等。(2)空间转录组分析结果包括不限于:数据质控、检测到的UMI、聚类、差异基因、饱和度、基因数中值、Spot指标分布统计、Spot分群信息和比例、Spot分群间相关性分析、Spot分群展示、差异基因列表和展示、富集分析、蛋白网络互作分析、转录因子注释、空间特异基因列表和展示。以及单细胞和空间转录组数据联合分析:单细胞和空间转录组数据的表达相关性、细胞类型对的共定位、空间转录组细胞类型注释、空间转录组轨迹分析、空间转录组互作分析等。
中标人收到采购人每批样本且检测合格后,开始进入测序,45个自然日内完成测序分析,提供标准分析报告。
6.本项目仪器配备标准:单细胞测序文库构建系统、自动细胞计数仪、生物分析仪。且具备数据分析软件和单细胞数据库。
7.因本项目产生的知识产权归采购方所有。
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服务时间
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服务期限:合同签订之日起1年。
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服务标准
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七、评审委员会(谈判小组)成员名单及打分明细(如有明细):
栾萍,范海明,刘福生,王军,苑文香
投标供应商/ 分项得分
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投标报价(元)
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技术
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综合实力
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诚信情况
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价格得分
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综合得分
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新格元(南京)生物科技有限公司
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378200.0
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42.2667
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11.8333
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5.0
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20.0
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79.1
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深圳市百诺星?科技有限公司
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379200.0
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28.5333
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0.0
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5.0
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19.947
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53.4803
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荔园基因科技(深圳)有限公司
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378700.0
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27.8667
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0.0
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5.0
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19.974
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52.8407
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八、公告期限
2022年04月02日至2022年04月05日
九、其他补充事宜
1. 中标通知书
采购人可在中标结果公告发布之日起3日后自行登录学校采购与招投标系统“采购结果”中打印电子中标通知书。
2.供应商质疑
投标供应商认为中标结果使自己的权益受到损害的,应当自本公告发布之日起七个工作日内以书面形式提出质疑。质疑材料可以采用现场或邮寄方式提交,采用邮寄方式提交的,交邮时间应在本公告发布之日起七个工作日内。现场提交、邮寄地址:深圳市南海大道3688号深圳大学汇元楼246室,谢老师。质疑咨询电话:0755-26057039。
3.投标文件
采购人可自行登录学校采购与招投标系统“采购结果”中查看投标文件。
十、凡对本次公告内容提出询问,请按以下方式联系。
名 称: 深圳大学
地 址: 深圳市南海大道3688号
联系方式: 韩老师,15989855755
项目联系人: 刘老师
联系方式:szucgps@126.com (邮件主题:“刘老师收-SZUCG20220049FW,0755-26351045”)
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