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SZUCG20220049FW 小鼠脊柱发育的单细胞转录组与空间转录组分析 中标(成交)结果公告

2022/04/02 17:21:00

一、项目编号:

SZUCG20220049FW

二、项目名称:

小鼠脊柱发育的单细胞转录组与空间转录组分析

三、投标供应商名称及报价(适用于公开招标):

序号

投标人名称

投标报价(人民币/元)

投标文件解密状态

1

新格元(南京)生物科技有限公司

378,200.00

正常解密

2

深圳市百诺星?科技有限公司

379,200.00

正常解密

3

荔园基因科技(深圳)有限公司

378,700.00

正常解密

四、候选中标供应商名单(适用于公开招标):

深圳市百诺星?科技有限公司,荔园基因科技(深圳)有限公司

五、中标(成交)信息

供应商名称:新格元(南京)生物科技有限公司

供应商地址:南京市江北新区药谷大道11号加速器二期6栋5楼 211500

中标(成交)金额: 378,200.00元

六、主要标的信息

(服务类)

名称

服务范围

服务内容

完成9例样本的单细胞转录组测序及其个性化分析;每个样本交付数据量不低于90G,且目标捕获细胞数≥6000个。同时进行5例样本的空间转录组建库测序,交付数据量250M reads/样本;并完成空间转录组标准分析、单细胞转录组和空间转录组的联合分析。

1. 合同签订后1天内,可提供保存效果长达72h的组织保存液;

2. 样本接收后1天内,可完成单细胞悬液制备,活性要求≥85%,浓度≥1*105 cells/ml;

3. 合同签订后14天内,完成所有样本的文库构建工作并提供文库质检报告。

4. 合同签订后1个月内完成所有样本的测序工作,测序质量及深度符合采购方要求,并提供标准化分析结果。

5. 合同生效后2个月内完成采购方要求的所有样本测序结果个性化分析。

6. 可提供生信分析服务到采购方学术成果正式发表为止。

7. 服务范围:组织取材、包埋、检测、实验经过汇报、项目结题报告。

服务要求

服务要求

1、样本处理要求:(1)单细胞转录组提供组织样本的保存试剂,保证样本离体72h后的稳定性,并能够用于后续单细胞悬液的制备。具备单细胞解离试剂,可对样本进行单细胞悬液的制备,单细胞解离试剂适用性广,可应用于多种样本类型的处理,解离过程不超过90分钟,解离活性要求≥85%,浓度≥1*105 cells/ml。(2)空间转录组样本包埋组织提取RNA,进行检测,RIN值大于7。

2、平台要求:利用荧光计数法和台盼蓝染色法两种方式同时进行细胞计数,随后对悬液进行单细胞捕获并构建测序文库;

3、建库和测序需求:(1)具备单细胞建库试剂盒,可用单细胞悬液构建带标签的转录组测序文库,可以满足不同样本的建库需求。采用安捷伦核酸片段分析仪对构建好的文库进行文库质量检测,对符合标准的文库进行后续的上机测序。

4、数据质控要求:(1)单细胞转录组对符合合格标准(活性≥85%,细胞总数≥1*105)的样本,目标捕获细胞数不低于6000个细胞/样本,测序数据量90G/样本。测序质量要求:Q20>85%,Q30>80%,碱基类型分布均匀;采用严格的数据指控标准,保证数据质量。(2)空间转录组数据量250M reads/样本。

5、数据验收标准

交付所有测序原始数据以及clean data记录报告及分析结果。

标准分析内容:QC分析、细胞分群、细胞分型展示、差异基因分析、monocle轨迹分析、marker基因展示、富集分析、蛋白互作网络、转录因子注释等。

个性化分析内容:细胞注释、批次效应去除、异质性分析、组间比对、轨迹分析(拟时序,RNA velocity)、通路分析、细胞通讯(细胞互作分析,转录因子调控网络分析)、细胞周期分析、细胞基因集合AUC分析、cNMF基因集合分析等。(2)空间转录组分析结果包括不限于:数据质控、检测到的UMI、聚类、差异基因、饱和度、基因数中值、Spot指标分布统计、Spot分群信息和比例、Spot分群间相关性分析、Spot分群展示、差异基因列表和展示、富集分析、蛋白网络互作分析、转录因子注释、空间特异基因列表和展示。以及单细胞和空间转录组数据联合分析:单细胞和空间转录组数据的表达相关性、细胞类型对的共定位、空间转录组细胞类型注释、空间转录组轨迹分析、空间转录组互作分析等。

中标人收到采购人每批样本且检测合格后,开始进入测序,45个自然日内完成测序分析,提供标准分析报告。

6.本项目仪器配备标准:单细胞测序文库构建系统、自动细胞计数仪、生物分析仪。且具备数据分析软件和单细胞数据库。

7.因本项目产生的知识产权归采购方所有。

服务时间

服务期限:合同签订之日起1年。

服务标准

七、评审委员会(谈判小组)成员名单及打分明细(如有明细):

栾萍,范海明,刘福生,王军,苑文香

投标供应商/ 分项得分

投标报价(元)

技术

综合实力

诚信情况

价格得分

综合得分

新格元(南京)生物科技有限公司

378200.0

42.2667

11.8333

5.0

20.0

79.1

深圳市百诺星?科技有限公司

379200.0

28.5333

0.0

5.0

19.947

53.4803

荔园基因科技(深圳)有限公司

378700.0

27.8667

0.0

5.0

19.974

52.8407

八、公告期限

2022年04月02日至2022年04月05日

九、其他补充事宜

1. 中标通知书

采购人可在中标结果公告发布之日起3日后自行登录学校采购与招投标系统“采购结果”中打印电子中标通知书。

2.供应商质疑

投标供应商认为中标结果使自己的权益受到损害的,应当自本公告发布之日起七个工作日内以书面形式提出质疑。质疑材料可以采用现场或邮寄方式提交,采用邮寄方式提交的,交邮时间应在本公告发布之日起七个工作日内。现场提交、邮寄地址:深圳市南海大道3688号深圳大学汇元楼246室,谢老师。质疑咨询电话:0755-26057039。

3.投标文件

采购人可自行登录学校采购与招投标系统“采购结果”中查看投标文件。

十、凡对本次公告内容提出询问,请按以下方式联系。

1.采购人信息

名 称: 深圳大学

地 址: 深圳市南海大道3688号

联系方式: 韩老师,15989855755

2.项目联系方式

项目联系人: 老师

联系方式:szucgps@126.com (邮件主题:“老师收-SZUCG20220049FW,0755-26351045”)

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