(一)服务内容及要求
1. 中标人需具备并采用GEXSCOPE单细胞测序技术平台,对采购人提供的新鲜样本进行单细胞转录组测序、单细胞免疫组库测序及后续生物信息学分析。
2.提供组织样本的保护试剂,用于储存样本,保证样本在离体后的稳定性,能够在组织离体72h内保持组织活性,可用于后续单细胞悬液的制备。
3.具备组织解离试剂,可对采购人提供的新鲜样本进行单细胞悬液的制备。单个样本解离过程低于60分钟。
4.使用细胞计数仪及显微镜对样本单细胞悬液进行质检;检测单细胞悬液的细胞浓度,细胞活性,成团率,细胞直径分布,有无红细胞污染等重要指标,满足建库要求。
5.具备单细胞测序文库构建系统,基于微孔原理的微流控技术完成细胞分离并通过带Barcode及UMI的磁珠对mRNA进行捕获标记。
6.自动化单细胞处理系统可搭载不同细胞通量规格的微流控微孔芯片,以满足不同细胞捕获通量的要求。
7.具备单细胞转录组和单细胞免疫组库试剂盒,可将单细胞悬液建成带标签的转录组测序文库和免疫组库文库,可以满足不同样本的建库需求。
8. 建库周期:在每批样品建库后5个工作日内向采购人提供cDNA和单细胞RNA测序文库的质检报告。检测合格、收到采购方确认送测样本启动信息、项目测序款项到账后30个工作日内完成建库测序。
9.测序平台:要求使用Illumina测序平台进行测序,测序策略为PE150,测序数据为90G/样本。测序质量要求:Q20>85%,Q30>80%,碱基类型分布均匀。
10.可进行标准分析内容展示:标准化展示的内容包括但不仅限于原始细胞-基因表达矩阵,平均每个细胞的基因检出数,细胞分群降维、差异基因展示、monocle轨迹分析,生成标准报告。
11.可进行个性化分析内容:个性化分析展示的内容包括但不仅限于细胞注释,亚群分析,组间对比,通路分析,拟时序分析,细胞基因集合分析,单细胞转录组与单细胞免疫组库联合分析。
12.成果交付期:在收到招标人提供的合格样本后45个日历日内完成测序并出具标准分析报告。个性化分析经双方沟通确定分析内容后另行确定分析周期。
(二)数据备份要求
2.1备份方式:为保证数据安全,备份载体的选择应多样化,需采用在线、离线相结合的方式实现多套备份。
2.2数据检验:备份数据也应进行检验。备份数据的检验的内容主要包括备份数据能否打开、数据信息是否完整、文件数量是否准确等。
2.3备份标签:数据备份后应在相应的备份介质上做好标签,以便查找和管理。
(三)保密要求
3.1中标单位须以协议的方式约定保密责任,遵守保密原则;泄密的责任在中标单位的,由中标单位承担相应的责任。
3.2单细胞测序资料的所有权归属采购单位,在项目结束时都必须完整移交。
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